《君九龄》讲述的是皇族公主楚九龄，因为叔叔杀死父亲，篡夺父亲皇位。在自己大婚的时候，刺杀叔叔失败。
师傅神医君应文将楚九龄改头换面，女儿君蓁蓁牺牲自己的生命，将楚九龄变成了君蓁蓁。楚九龄改名君九龄后，从新建立了医馆九龄堂。在民间治痘疮，护百姓。并与朱瓒与宁云钊、前夫陆云旗、方家独子方承宇四个人产生情感的故事。
通过不断的竞争，方家独子方承宇最先被淘汰——君九龄与方承宇成亲，是为了救治他的腿。
等到方承宇的腿治好之后，君九龄马上跟他和离。虽然方承宇对君九龄情根深种，后来更是将自己家里，当今皇帝在做王爷时，给他们家的手谕，交给九龄。九龄还是不会对方承宇有感觉。因为，君九龄要对付的是当今皇上。方家对当今皇上而言，也是一枚眼中钉。现在的方家，在君九龄的操作下，勉强可以自保。但是，对君九龄的复仇没有任何助力。
陆云旗也被淘汰。
第一：因为陆云旗就是当今皇帝篡位的帮凶。是当今皇帝提拔他成为武德司的统领。他与当今皇帝是利益共同体。
第二：陆云旗为人嚣张霸道。因为君九龄使用九龄堂的名字，就要砸九龄堂的招牌。威逼君九龄做妾。加上陆云旗现在还是君九龄的姐夫。九龄公主从弟弟的口中听说，陆云旗对自己的姐姐并不好。君九龄现在对陆云旗只会更加反感。
在刚刚上传《君九龄》的剧情中，陆云旗强逼君九龄为妾，引发了与朱瓒的冲突。陆云旗设局，质问他与君九龄的关系。朱瓒无言以对。关键时刻，是宁云钊说君九龄是自己的未婚妻，为朱瓒解围。
虽然宁云钊帮助君九龄解围，但是，小编认为，君九龄不会选择他。而是选择朱瓒！
第一：君九龄想要推翻现在的皇帝，兵权是最重要的。宁云钊是文官。而朱瓒出身武将世家。连皇帝都忌惮朱瓒家的兵权。
第二：宁云钊的母亲和妹妹目中无人。在中国，婆婆和小姑是很多媳妇的公敌。在有婚约的时候，宁云钊的母亲和妹妹，就做了很多伤害君九龄的事情。君九龄不会自讨苦吃。当初君九龄送宁云钊一个梨子，就表示自己不可能跟宁云钊在一起的态度。
第三：朱瓒与君九龄的情感基础和共同相处后的患难之情。
朱瓒与君九龄从小就相识，朱瓒是君九龄小时候的保护神。君九龄有任何的要求，朱瓒都会满足她。在君九龄治痘疮的时候，朱瓒对君九龄的帮助最大。尤其在朱瓒生痘疮的时候，君九龄的态度，已经表明，她的心已经彻底放在了朱瓒身上
